События разворачиваются в Академграде — городе, где у некоторых подростков пробуждаются необычные силы. Их называют эсперами, и многие из них учатся в местных школах, бок о бок с обычными людьми. Этот город создан специально, чтобы помогать одарённым ученикам развивать свои способности, проходя ступени обучения. Пятый уровень считается одним из самых сложных и опасных, тогда как нулевой — слабейшим. Среди них выделяется Микото, способная управлять молнией, благодаря чему её перевели на высший уровень. Её техника, известная как "Рейлган", делает её грозной противницей — даже простая монета в её руках превращается в смертельное оружие.
Мисаки, ещё одна известная студентка, пользуется уважением среди сверстников, но Куроко не может смириться с тем, что у Микото такая разрушительная сила. Сама она обладает лишь четвёртым уровнем, но это не мешает ей восхищаться подругой. Хотя Сирай и Микото не раз сходились в схватках, никто так и не смог одолеть последнюю. Мисаки об этом ничего не знает, но Куроко её искренне любит. В их мире победа зависит не только от силы, но и от опыта, а однажды на кону оказалась даже их дружба.
Чтобы не отставать, Куроко приходится долго тренироваться, оттачивая свои навыки. В её арсенале есть один козырь, который может перевернуть ход любого боя. Но сможет ли она использовать его в решающий момент? В Академграде каждый день приносит новые испытания, и только самые стойкие смогут доказать, что достойны зваться сильнейшими.